El personal del Departamento es muy activo en el área de investigación y de desarrollo de materiales para la docencia, por lo que constantemente se participa en las convocatorias de apoyo a proyectos de organizaciones como CONACYT y DGAPA.

Gracias a los proyectos que obtienen los profesores se ha equipado una serie de laboratorios para apoyar a la investigación, en los cuales los estudios se enfocan a las áreas de endocrinología, cultivos celulares, fertilización in Vitro y biología molecular.

Por otro lado, el Departamento de Reproducción cuenta con una clínica de reproducción canina, ubicada junto al edificio 16 de la FMVZ, en la que se brinda servicio al público general.